廣泛使用的方法,以確定細胞凋亡的基因組DNA的瓊脂糖凝膠電泳和DNA段分析基于分析3 H -胸苷,另外,5 -溴-2'-脫氧尿苷。該方法涉及從零散,低分子量的DNA不分段,高分子量的DNA分離在一個特定的細胞群。因此,這些方法并不在一個特定的細胞群提供單個細胞的命運的信息,特別是在組織切片。另外,個別細胞凋亡可能顯微鏡確認,因為核染色質凝聚和碎裂的外觀特征,但這種方法是主觀的,不限于一個相對狹窄的時間窗口時的形態學變化大的是細胞凋亡的特點是DNA降解,這是有選擇性的DNA鏈接的internucleosomal地區處于早期階段。可能產生DNA斷裂雙鏈和單鏈DNA斷裂(尼克斯)。兩種類型的休息可以自由3'-OH末端修飾核苷酸標記(例如在酶催化反應,生物素-dUTP標記,地高辛-dUTP標記,熒光的dUTP)檢測。末端轉移酶(TDT)催化脫氧模板獨立聚合單和雙鏈DNA的3'-末端。這種方法也被稱為TUNEL法(牛逼 ð ü DT-介導的TP-X的列印 ICK é ND 升abeling)。另外,自由3'-OH基團,可使用DNA聚合酶標記通過名為尼克翻譯的模板依賴的機制。然而,TUNEL法被認為是更敏感和更快捷。